Nuo fiziologijos požiūriu autogeninis mokymas leidžia kontroliuoti sužadinimo ir slopinimo procesus, pasiekti jų pusiausvyrą. Nuolat naudojant šią techniką, padidėja organizmo gebėjimas greitai prisitaikyti prie besikeičiančių aplinkos sąlygų, įjungiami psichiniai procesai, normalizuojama nervų sistemos veikla, pagerėja atmintis. Labai svarbu yra autogeninis mokymas nuovargio sindromui pašalinti, atstatant normalią organizmo emocinę būseną po perdėto streso, atminties ir dėmesio gerinimui. Terapiniais tikslais šis metodas naudojamas neurozėms ir kitiems funkciniams sutrikimams, taip pat pagrindinių kūno sistemų darbo normalizavimui ir medžiagų apykaitos procesų reguliavimui.
Autogeninis mokymas gali būti skirtas studijoms ir asimiliacijai beveik visiems. Kadangi šio psicho-higienos technikos svarba normaliam kūno funkcionavimui yra tiesiog neįkainojama, o pačiam mokymui nėra reikalingos jokios specialios įrangos ar treniruoklių, o tiems, kurie nori išmokti autogeninio mokymo metodus, tai yra tik keletas minučių per dieną tokioms pratyboms. Tačiau net ir tokio trumpo laiko pakanka gebėjimui tinkamai įtampyti ir atsipalaiduoti raumenims, sutelkti dėmesį į pasirinktą objektą, reguliuoti emocinę būseną, išlaikyti įprastą nervų sistemos autonominės dalies veikimą ir taip stebėti vidaus organų funkcinę būklę.
Pagrindinė autogeninio mokymo dalis yra autosudiegimo procesas, kuriame vartojamos žodinės formos. Frazės turėtų būti išreikštos imperatyviu tonu iš pirmojo asmens singlų, ty jie turėtų prasidėti maždaug taip: "Aš esu ramus ... jaustis įsitikinęs ..." ir kt. Pagal autogeninio mokymo taisykles tokiose frazėse neturėtumėte naudoti dalelės "ne", tai reiškia, kad vietoje žodžio "Aš nesu blogai" turiu pasakyti "Aš esu sveikas", o vietoj "Aš nesijaudinu" geriau sakyti "Aš esu visiškai ramus". Ir šios išraiškos turi būti išreikštos tam tikra tvarka. Praktikos pradžioje frazės turėtų būti išreikštos atsipalaiduoti ir atsipalaiduoti, tada frazės, kurios tiksliai įtakoja kūną ir padeda pasiekti pagrindines sesijos psichoterapines užduotis, o kai pratimas yra baigtas, raiščiai, kurie turi atsipalaiduoti ir turėti mobilizavimo efektą. Tinkamai panaudojus techniką, žmogus patenka į šviesios pusdemonos būseną, kurioje vyksta savipagalbos savianalizmas, kuris padeda palaikyti normalų kūno funkcionavimą.
Nustatyta, kad esant skirtingoms emocinės būklės rūšims, padidėja vienos ar kitos raumenų grupės įtampa. Pavyzdžiui, jei nuotaika bloga, padidėja įtampa kvėpavimo sistemos raumenyse, o su baimės padidėja veido raumenų įtempimas. Todėl, pasiekus autogeninį tam tikrų raumenų relaksacijos mokymą, galima pasiekti normalų organizmo funkcionavimą ir pagerinti jo psichinę būklę. Taigi, remiantis ryšiu tarp raumenų grupių ir emocinės kūno būkle, galima žymiai sumažinti neuro-emocinę pertvarką, mažinti nuovargį ir taip skatinti greitą reikiamo efektyvumo lygio atkūrimą.
Nepaisant akivaizdaus autologinio mokymo paprastumo ir didžiulės teigiamos vertės normaliam kūno funkcionavimui, vis dar yra tam tikrų sunkumų naudojant šį metodą. Pavyzdžiui, vaikams iki 12 metų autogeninis mokymas dažnai yra neefektyvus, nes šiuo amžiuje dar nėra pakankamai sąmoningo požiūrio į savo asmenybę. Vyresni žmonės taip pat gali turėti tam tikrų sunkumų bandydami įsisavinti šį psicho-higienos metodą, nes su amžiumi skersinių raumenų tonas nuolat mažėja, o raumenų atpalaidavimas tampa daug sunkesnis.